酸土脂环酸芽孢杆菌芽孢在低pH条件下萌发的蛋白组学研究

1 (p1): 第一章 绪论
1 (p1-1): 一、酸土脂环酸芽孢杆菌
1 (p1-1-1): （一）酸土脂环酸芽孢杆菌的特性
2 (p1-1-2): （二）酸土脂环酸芽孢杆菌的耐热性
4 (p1-1-3): （三）酸土脂环酸芽孢杆菌的危害
6 (p1-1-4): （四）酸土脂环酸芽孢杆菌的鉴定与检测
7 (p1-1-5): （五）酸土脂环酸芽孢杆菌的控制
10 (p1-2): 二、细菌芽孢的结构及生理特性
10 (p1-2-1): （一）芽孢结构
12 (p1-2-2): （二）芽孢形成
14 (p1-2-3): （三）芽孢复苏
17 (p1-3): 三、非标记蛋白组学分析
18 (p1-3-1): （一）基于鉴定蛋白的肽段数的定量方法
19 (p1-3-2): （二）基于质谱峰强度的定量方法
21 (p2): 第二章 营养因子对酸土脂环酸芽孢杆菌生长及芽孢形成的影响
22 (p2-1): 一、材料与方法
22 (p2-1-1): （一）材料与仪器
23 (p2-1-2): （二）培养基制备
23 (p2-1-3): （三）试验方法
25 (p2-1-4): （四）数据处理
26 (p2-2): 二、结果分析
26 (p2-2-1): （一）酸土脂环酸芽孢杆菌生长及芽孢形成
27 (p2-2-2): （二）碳源对酸土脂环酸芽孢杆菌生长及芽孢形成的影响
28 (p2-2-3): （三）氮源对酸土脂环酸芽孢杆菌生长及芽孢形成的影响
29 (p2-2-4): （四）无机盐对酸土脂环酸芽孢杆菌生长及芽孢形成的影响
32 (p2-2-5): （五）不显著因素交互作用对酸土脂环酸芽孢杆菌生长和芽孢形成的影响
34 (p2-3): 三、结论
35 (p3): 第三章 pH对酸土脂环酸芽孢杆菌芽孢萌发的影响
36 (p3-1): 一、材料与方法
36 (p3-1-1): （一）主要仪器
36 (p3-1-2): （二）菌种与培养基
36 (p3-2): 二、试验方法
36 (p3-2-1): （一）芽孢收集
38 (p3-2-2): （二）pH对酸土脂环酸芽孢杆菌芽孢萌发率的影响
38 (p3-2-3): （三）pH对酸土脂环酸芽孢杆菌芽孢萌发形态的影响
38 (p3-3): 三、结果与分析
38 (p3-3-1): （一）pH对酸土脂环酸芽孢杆菌芽孢萌发率的影响
39 (p3-3-2): （二）pH对萌发过程中的酸土脂环酸芽孢杆菌芽孢形态的影响
42 (p3-4): 四、讨论
44 (p4): 第四章 Label-free技术筛选酸土脂环酸芽孢杆菌芽孢低pH下萌发过程的差异表达蛋白
45 (p4-1): 一、仪器和试剂
46 (p4-2): 二、试验方法
46 (p4-2-1): （一）菌体蛋白样品的制备、定量和检测
46 (p4-2-2): （二）蛋白质的FASP酶解
47 (p4-2-3): （三）酶解产物的LCMS/MS分析
47 (p4-2-4): （四）Maxquant的非标记分析
47 (p4-2-5): （五）生物信息学分析
48 (p4-2-6): （六）RNA提取及实时定量PCR验证
50 (p4-2-7): （七）数据分析
50 (p4-3): 三、结果与分析
50 (p4-3-1): （一）总蛋白浓度及各组样品平行性
51 (p4-3-2): （二）LC-ESI-MS/MS分析芽孢在低pH下萌发时的差异表达蛋白
51 (p4-3-3): （三）芽孢萌发相关蛋白的生物信息学分析
53 (p4-3-4): （四）实时定量PCR验证显著差异蛋白的基因表达
53 (p4-4): 四、讨论
60 (p5): 附表
60 (p5-1): 附表1 差异表达蛋白
67 (p5-2): 附表2 KEGG通路分析
75 (p6): 参考文献